Em meados de 1920, estabeleceu-se na região da atual Nicolau Vergueiro o primeiro casal de colonizadores, os quais conheciam o local pelo nome de “Pinhal Fechado”, pela grande quantidade de Pinheiros que existiam por lá. Esse primeiro casal chamava-se Pedro e Maria Souza. Quando chegaram, logo trocaram a localidade de nome para “Arroio dos Portes”. Até antes de ser designado distrito de Marau, em 1961, o local era conhecido por este nome. Em 1961 passou a ser conhecido por Nicolau Vergueiro. O nome surgiu em homenagem ao Sr. Nicolau de Araújo Vergueiro, que foi um grande médico e realizou atendimentos por muitos anos no município gratuitamente. No dia 20 de março de 1992, foi criado o município. Sendo assim, neste ano, comemora 31 anos de emancipação político-administrativa. O presidente do Legislativo, Marcelo Felini, deixou sua mensagem aos munícipes pela passagem do aniversário:

“Primeiramente, quero agradecer às pessoas que se empenharam, no ano de 1992, na luta de emancipação de Nicolau Vergueiro, na época distrito de Marau. Reconhecimento também para aqueles que acreditaram e apostaram em nosso município, que aqui permaneceram, investindo, empreendendo e crendo no potencial de nossa terra. Gratidão as pessoas que vieram de fora e aqui fizeram história, residindo neste local e ajudando no desenvolvimento de nossa comunidade. Obrigado ao povo do interior, que produz em diversos segmentos e é a base de nosso município, essencialmente agrícola e agropecuário. Meu agradecimento também à Prefeitura Municipal e aos funcionários pelo trabalho desempenhado por aqui durante esses 31 anos. A todos, um feliz aniversário pela história de Nicolau Vergueiro”.